Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2a3Q64518 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms