Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TsnQ62348 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TsnQ62348 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TsnQ62348 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TsnQ62348 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TsnQ62348 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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TsnQ62348 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TsnQ62348 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms