Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms