Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfap2bQ61313 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms