Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms