Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hif1aQ61221 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms