Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd6Q61003 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd6Q61003 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms