Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rbbp4Q60972 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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