Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxd4Q60688 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms