Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm1Q60636 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm1Q60636 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms