Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Xrcc1Q60596 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms