Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Slc5a6Q5U4D8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Slc5a6Q5U4D8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms