Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam71bQ5STT6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms