Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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