Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trappc1Q5NCF2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms