Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufaf2Q59J78 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufaf2Q59J78 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms