Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spire1Q52KF3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms