Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trp53i11Q4QQM4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms