Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms