Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Defa20Q45VN2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms