Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Carmil2Q3V3V9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Carmil2Q3V3V9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms