Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc27Q3V036 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc27Q3V036 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms