Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pfdn4Q3UWL8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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