Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca4bQ3UW98 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca4bQ3UW98 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms