Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms