Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms