Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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