Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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