Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

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Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mmp25Q3U435 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp25Q3U435 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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