Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hace1Q3U0D9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms