Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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