Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc10Q3TLI0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc10Q3TLI0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms