Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp39Q3TIX9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp39Q3TIX9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms