Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gata4Q08369 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms