Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pou6f1Q07916 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou6f1Q07916 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms