Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf3Q07104 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms