Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Siah1bQ06985 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah1bQ06985 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms