Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Caprin2Q05A80 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms