Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fmn1Q05860 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fmn1Q05860 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms