Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox12Q04890 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms