Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nf1Q04690 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms