Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scg2Q03517 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms