Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msx2Q03358 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms