Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp1Q00915 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms