Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra1P97785 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms