Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pitx2P97474 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms