Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
H3f3aP84244 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms