Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx1P83917 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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