Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx1P81068 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms