Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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